Над Японией появляется неопознанный летающий объект, что побуждает несколько героических команд начать его исследование. Их планы нарушаются, когда основной оборонительный робот, Мазингер, оказывается недоступен из-за технического обслуживания. Единственным доступным для противостояния угрозе становится робот Геттер. В ходе столкновения пилоты Геттера сталкиваются не с механическим кораблем, а с агрессивной живой машиной, природа которой им непонятна.

Это существо, получившее имя Гилгилган, начинает атаку на Японию, выпуская создания, способные поглощать металл. Даже Великий Мазингер, вернувшийся в строй, не может полностью остановить противника и отступает. Перед лицом нарастающей угрозы пилоты и командование различных баз приходят к выводу о необходимости совместных действий. Преодолевая прежние разногласия, они объединяют ресурсы и знания, чтобы противостоять растущей мощи Гилгилгана.