Действие происходит в стране, где правит огонь, в деревне Скрытый Лист. Ситуация осложняется исчезновением ниндзя, обладающих уникальными способностями. Первоначально подозрения падают на огненную стихию. Цунаде поручает Какаши задачу по предотвращению надвигающегося военного конфликта и оказанию помощи жителям деревни. Это поручение получает высокий приоритет. Наруто тяжело переживает сложившееся положение, поскольку он потерял своего наставника. Какаши использовал два тренировочных колокольчика во время первого урока для своей команды.

Эти колокольчики теперь находятся у главного героя. Чтобы вернуть своего учителя, Наруто предстоит пройти длинный путь и преодолеть серию испытаний. Он понимает, что признание со стороны других жителей деревни может быть достигнуто только через это. Герой осознаёт необходимость продуманных действий, поскольку поспешность не приведёт к возвращению наставника. В процессе ему предстоит столкнуться с различными опасностями, но рядом всегда находятся преданные товарищи, готовые оказать поддержку в нужный момент.