Учёный Горилло Гродд создаёт машину времени, которую решает испытать Брюс Уэйн. В процессе эксперимента происходит сбой, и Брюс оказывается в феодальной Японии. В этот период регионом правят жестокие правители, терроризирующие местное население. Брюс Уэйн, приняв решение вмешаться, вновь использует образ Бэтмена, чтобы противостоять угнетателям. Ситуация усложняется, когда выясняется, что действия антагонистов в прошлом способны повлиять на ход истории в настоящем времени.

Для эффективной борьбы в новых условиях Бэтмен осваивает местные боевые искусства и тактику ниндзя. Его основной задачей становится нейтрализация всех противников, угрожающих мирным жителям, что является необходимым условием для возвращения в своё время. Тем временем в настоящем, в отсутствие Бэтмена, его давний противник Джокер активизирует преступную деятельность. Поддержку Брюсу в этой ситуации оказывают Альфред Пенниворт и Женщина-кошка, помогая ему сохранять решимость. Сюжет строится вокруг противостояния Бэтмена с местными тиранами и параллельной угрозы в Готэм-Сити.