Юу и Харука — давние подруги, которые всегда проводят время вместе. При поступлении в старшие классы их рассаживают за разные парты. Чтобы сохранить привычную близость, девушки предпринимают нестандартный шаг. В их жизни появляется Сакура, выполняющая обязанности хранительницы времени. Её задача — поддерживать стабильность мира, защищая ход истории от вмешательств. В процессе противостояния силам, стремящимся изменить прошлое, её действия оказывают влияние на различные временные периоды и измерения.

Первым заданием Сакуры становится поимка вора Сугинами, появившегося в эпоху Эдо. Противник оказывается подготовлен: с помощью вызванных им волшебниц, Немо и Михару, ему удаётся скрыться в потоке времени. Несмотря на это, Сакуре возвращает похищенное сокровище той эпохи. Дальнейшие действия должна определить организация по сохранению исторических событий, где состоит Сакура. Мотивы вора, выбравшего период Эдо, и природа помогающих ему волшебниц пока остаются неясными. Эти события начинают влиять на отношения между Юу и Харукой, ставя под вопрос будущее их длительной дружбы.