Сатоси и его покемон Пикачу продолжают совместные путешествия. В процессе они развили крепкую взаимную связь и научились эффективно сотрудничать. Их путь привел к знакомству с различными покемонами и людьми, обогатив их опыт. Теперь дуэт направляется к древнему городу Дахар, не подозревая о трудностях, которые ожидают их впереди.

Город Дахар известен событием столетней давности, когда враждебный покемон обрушил на него природные бедствия. Местный житель сумел поймать этого покемона и заключить его в стеклянный сосуд, после чего в городе наступил длительный период спокойствия. Однако спустя годы стенки сосуда начали разрушаться, а его защитные свойства ослабевать. Это совпало по времени с прибытием в город Сатоси, Пикачу и их новых спутников, которым предстоит столкнуться с возрождающейся угрозой.