Канаме Мадока учится во втором классе средней школы в городе Митакихара. Она живет с семьей: отцом, который ведет домашнее хозяйство, матерью, занятой на работе, и младшим братом. Мадока проводит обычные школьные дни, общается с друзьями и помогает по дому. Ее жизнь протекает размеренно, без заметных потрясений.

Однако повторяющийся сон, в котором хрупкая девушка сражается с монстрами, нарушает привычный порядок. Эти образы преследуют Мадоку и в школе. Ситуация усложняется, когда она встречает ту самую девушку-воительницу среди учеников. Мадоке предлагают заключить контракт с волшебницей, чтобы присоединиться к их команде. Этот выбор можно сделать только один раз, и его последствия будут необратимы.