После серии неудач на крупных научных конкурсах исследовательская группа профессора Ксавьера распадается, что приводит к прекращению её ключевых проектов. Вскоре над Японией нависает угроза глобального катаклизма, способного уничтожить человечество. Для предотвращения катастрофы требуются экстраординарные меры и ресурсы, которых у оставшихся учёных нет.

В этой ситуации появляется команда спасателей, известная как Люди Икс. Её члены обладают различными сверхспособностями, которые могут быть применены для нейтрализации угрозы. Действия группы направлены на решение кризиса, что также соответствует их личным целям и профессиональным амбициям в области использования уникальных возможностей.