Несколько десятилетий назад существо, известное как Великан Света, присоединилось к научно-исследовательской группе под руководством Хаяте Сину для противодействия угрозе со стороны монстров Кайдзю. Спустя годы планета находится в состоянии относительного спокойствия, и память о прошлых событиях постепенно стирается. Однако новая опасность приближается к Земле, создавая угрозу её существованию. Противостоять этой угрозе предстоит группе, известной как Ультрамены.

Центральной фигурой повествования является Синдзиро, сын Хаяте Сину, который стал первым носителем силы Ультрамена. Хаяте долгое время скрывал от сына своё прошлое, но был вынужден раскрыть правду после нападения на Синдзиро. Он передал сыну устройство "Фактор Ультрамена", которое наделяет обладателя повышенными физическими способностями. Хаяте продолжает участвовать в борьбе, однако исход нового противостояния остаётся неопределённым. Параллельно Синдзиро приходится совмещать свои новые обязанности с обычной учебой.