Третий сезон продолжает историю Нацуки Субару, который ищет ответы на возникшие у него вопросы. Ранее он встретил девушку по имени Эмилия и оказался в альтернативном мире, где распространены магия и ведьмы. Субару вовлечён в события, способные изменить ход происходящего вокруг. Его взаимодействия с различными персонажами, включая потенциально опасных, выработали у него осторожность. Мотивацией для его действий служит защита тех, кого он считает друзьями.

Сюжет развивается вокруг осознания Субару, что его путь ещё не завершён и ему предстоит сделать определённый выбор. Он противостоит могущественным противникам, стремясь обезопасить Эмилию, однако эти конфликты являются лишь частью более масштабного противостояния. Другие силы намерены дестабилизировать положение в мире. Параллельно Субару пытается укрепить отношения с союзниками, которые помогают ему в поисках информации. Его противники активно ищут уязвимости в его положении, чтобы нанести удар.