Накадзима Нанао является учеником специального курса в учебном заведении, расположенном на удаленном необитаемом острове. Эта школа предназначена для подготовки молодых людей, обладающих особыми навыками, к борьбе с существами, классифицируемыми как враги человечества. Учебный процесс сосредоточен на развитии индивидуальных способностей учащихся, которые в перспективе должны стать основным оружием. Повседневная жизнь Нанао протекает в среде, где доминируют сверстники, чьи силы делают их опасными. Он регулярно сталкивается с насмешками и преследованиями со стороны одноклассников из-за отсутствия у него заметных способностей, что выделяет его на фоне остальных учеников.

Рутинное существование Нанао изменяется с прибытием в класс двух новых учащихся: Онодера Кёя и Хиираги Нана. Школьная система предполагает, что государство полностью финансирует обучение одаренных подростков, создавая условия для развития их талантов. Однако истинные мотивы одной из новеньких, Хиираги Нана, остаются скрытыми от окружающих. Внешне производя впечатление неловкого и замкнутого человека, она методично устанавливает контакты с другими учениками. Ее присутствие в школе обусловлено конкретным заданием, целью которого является ликвидация учащихся, обладающих особыми способностями.