Аниме основано на игровой франшизе о существах под названием покемоны. Главный герой, начинающий тренер, ставит перед собой цель зарегистрировать всех покемонов в специальном устройстве. Для этого он отправляется в путешествие по различным локациям, где встречает других тренеров и заключает с ними временные союзы. В процессе сюжета персонаж изучает сильные стороны своих покемонов и применяет эти знания в схватках.

Действие происходит в определённом регионе, где обитает редкий покемон Аркеус. Чтобы приблизиться к нему, тренеру необходимо преодолеть ряд испытаний, включающих стратегические битвы и исследование территории. Персонаж последовательно использует накопленный опыт и способности своих покемонов для выполнения поставленной задачи. Сюжет строится вокруг взаимодействия с другими тренерами и постепенного продвижения к цели.