Тайчи Ягами готовился к поездке в детский лагерь, когда Токио подвергся масштабной кибератаке. Городская инфраструктура, включая транспортную систему, вышла из строя. Обеспокоенный судьбой матери и сестры, Тайчи вместе с другом Коширо Идзуми направился в метро, чтобы помочь им. В подземке произошел инцидент, в результате которого подростки необъяснимым образом перенеслись в альтернативную реальность.

Это пространство, известное как Цифровой мир, населено разумными формами данных — дигимонами. Первым, кого встретили Тайчи и Коширо, стал дигимон по имени Агумон, напоминающий желтого динозавра. Через специальное устройство Коширо удалось установить связь с Идзуми, который объяснил природу этого мира. Не все дигимоны настроены дружелюбно; некоторые из них, проникая в реальный мир, становятся причиной кибератак и представляют угрозу для человечества. Подросткам предстоит противостоять этим существам, способным использовать мощное оружие, чтобы предотвратить их вторжение в Японию.