После вторжения инопланетных существ, которые принесли массовые разрушения и гибель, человечество оказалось в состоянии постоянного бегства. Уцелевшая часть населения была вынуждена скрываться в различных убежищах, при этом многие выжившие страдали от полной потери памяти. Отсутствие эффективного оружия против новой угрозы усугубляло ситуацию, хотя определенные запасы вооружения у людей сохранились. Планета постепенно заполнялась пришельцами, что делало поиск безопасного укрытия ежедневной необходимостью.

В ответ на кризис был начат проект по созданию специализированного оружия. В рамках этой программы из приютов стали отбирать молодых людей для обучения управлению боевыми роботами. Целью стало формирование робота по имени Мусаси, конструкция которого основана на сплаве мегатронии. Каждый кандидат в пилоты проходит индивидуальные испытания, связанные с высокой степенью риска для жизни, в процессе подготовки к противостоянию инопланетной угрозе.