Сериал повествует о девушке по имени Ноль Два, чье обозначение является частью системы кодов, применяемой к её окружению. Главная героиня страдает от амнезии неизвестного происхождения, сохранив лишь воспоминания о периоде заточения. Её прошлое до заключения полностью стерто. В памяти Ноль Д Two изредка возникают фрагменты, связанные с женщиной, исполнявшей роль матери и оказавшей значительное влияние на её становление. Позже к ней возвращается воспоминание о том, как эта женщина подарила ей иллюстрированную книгу.

Внимание героини привлекли не текст, а изображения в книге. Выясняется, что несколько лет назад над Ноль Два проводились эксперименты в научном комплексе «Сад». В этой лаборатории она встретила мальчика по имени Хиро, имевшего код Ноль Шестнадцать. Они предприняли попытку побега, которая была быстро пресечена. В этот момент Хиро пообещал жениться на Ноль Два. После поимки память обоим была стерта, что привело к взаимному забвению. Однако позже у Ноль Два начинают возвращаться чувства к тому, кого она любила, и она принимает решение разыскать его.