Третий сезон продолжает историю Нацуки Субару, который ищет ответы на возникшие у него вопросы. Ранее он встретил девушку по имени Эмилия и оказался в альтернативном мире, где распространены магия и ведьмы. Субару вовлечён в события, способные изменить окружающую действительность. Его взаимодействие с различными персонажами, включая потенциально опасных, выработало у него осторожность. Действия главного героя во многом мотивированы желанием защитить своих союзников.

Сюжет развивается вокруг осознания Субару, что его путь ещё не завершён и требует принятия решений. Он продолжает противостоять могущественным противникам, чтобы обеспечить безопасность Эмилии, однако это лишь часть более масштабного конфликта. Другие силы стремятся дестабилизировать положение в мире. Параллельно Субару пытается укрепить отношения с друзьями, готовыми помочь в его поисках. Противники, в свою очередь, активизируют усилия, чтобы обнаружить уязвимости главного героя и нанести ему ущерб.