После победы над преступной организацией "Гильдия", достигнутой совместными усилиями Ацуси Накадзимы и Рюносукэ Акутагавы, в городе установилось перемирие. Долголетний конфликт между "Портовой мафией" и "Вооружённым детективным агентством" был прекращён. Это создало условия для периода относительного спокойствия, в котором персонажи получили возможность избегать новых потерь.

Однако поступающая информация о выживших членах "Гильдии", планирующих потенциальную атаку, ставит под угрозу хрупкий мир. Параллельно Ацуси и его союзникам приходится противостоять другой организации — "Крысам мёртвого города", возглавляемой таинственным Достоевским. Для противодействия его планам, представляющим угрозу для города, "Портовой мафии" и детективам вновь приходится объединять свои силы.