В результате глобального события, известного как "окаменение", человеческая цивилизация прекратила существование. Старшеклассник Тайдзю Оки, избежавший превращения в камень по неизвестной причине, пробуждается спустя тысячелетия. Он обнаруживает мир, где природа поглотила следы технологий, а всё человечество, включая девушку, которой он собирался признаться, представляет собой каменные статуи. Его первостепенной задачей становится поиск других выживших и понимание природы произошедшей катастрофы.

В ходе исследований Тайдзю находит своего одноклассника, гениального учёного Сэнку Исигами, который также сохранил сознание. Объединив усилия, они используют научный метод для выживания и восстановления базовых технологий в каменном веке. Их долгосрочная цель — раскрыть тайну окаменения, найти способ вернуть к жизни остальное человечество и воссоздать утраченную цивилизацию с нуля, сталкиваясь с логистическими трудностями и неожиданными вызовами нового мира.