В 1940-х годах человечество столкнулось с катастрофой, вызванной загадочной угрозой, известной как Неорои. Традиционные вооруженные силы оказались неэффективны против этого врага, что привело к масштабным разрушениям и упадку государств. В этих условиях учёный разработал технологию "Ударных модулей" — устройств, сочетающих научные и магические принципы. Эти модули были созданы для усиления способностей ведьм, которые оказались единственными, способными противостоять Неорои. После гибели учёного его наработки легли в основу военной программы по подготовке специальных операторов.

Йошика Мияфудзи, дочь погибшего учёного, унаследовала семейный магический дар. Вопреки военному применению этой силы, она стремилась следовать примеру матери и бабушки, используя свои способности для помощи и исцеления людей. Её планы изменились после визита армейских представителей, которые предложили ей присоединиться к элитному подразделению "Штурмовых ведьм". Это предложение поставило перед Йошикой выбор между её пацифистскими убеждениями и необходимостью применить свой дар в конфликте, определяющем будущее человечества.