Макото Юки поступает в частную академию Гэккокан и переезжает в студенческое общежитие. Его жизнь меняется после нападения загадочного существа по имени Тень, которое пробуждает у него способность вызывать Персону — сверхъестественную сущность. Способности Макото привлекают внимание членов секретного клуба SEES, который занимается исследованием и устранением Теней. Несмотря на изначальное равнодушие, Макото соглашается присоединиться к группе. В процессе совместных действий против угрозы он постепенно устанавливает связи с другими участниками клуба.

По мере развития событий участники SEES продолжают расследование природы Теней и так называемого «Тёмного часа», стремясь найти способ положить этому конец. Макото сталкивается с внутренним противоречием: с одной стороны, необходимость противостоять угрозе, с другой — желание сохранить своё место в группе, которое стало для него важным. Этот конфликт усложняет поиск баланса между его обычной жизнью и обязанностями, связанными с борьбой против Теней.