Деятельность человечества пробудила от многомиллиардного сна гигантских существ, скрывавшихся в океанских глубинах. Этих существ, названных кайдзю, не остановило ни одно из созданных людьми видов оружия. Монстры вышли на сушу и начали уничтожать всё на своём пути, одновременно вступая в конфликты друг с другом за доминирование. Результатом их столкновений становились масштабные разрушения и многочисленные человеческие жертвы. Люди утратили положение доминирующего вида на планете, столкнувшись с превосходящей силой.

Наиболее мощным среди кайдзю оказался гигантский ящер Годзилла, способный испепелять противников радиоактивным дыханием. Не сумев противостоять угрозе, оставшееся человечество покинуло Землю в поисках новой планеты, однако за двадцать лет космических странствий подходящий мир найти не удалось. Харута, эвакуированный с Земли в четырёхлетнем возрасте, считает бегство проявлением трусости. Его позиция получила поддержку, и на общем собрании было принято решение прекратить скитания и начать операцию по возвращению и отвоеванию родной планеты.