Аниме "Врата Штейна" основано на одноименной манге и вышло в эфир 6 апреля 2011 года. Сюжет разворачивается в современной Японии и повествует о группе молодых изобретателей, которые создают устройство из микроволновой печи. Это устройство способно отправлять текстовые сообщения в прошлое. В процессе доработки механизма для потенциальной транспортировки людей, герои привлекают внимание секретной организации SERN.

Организация SERN проводит собственные исследования в сфере путешествий во времени и изучения параллельных миров. Она известна тем, что ликвидирует независимых учёных и присваивает их разработки. Осознавая угрозу со стороны SERN, которая установила их личности и местонахождение, главные герои вынуждены использовать своё изобретение для перемещений во времени. Их цель — опережать противника и защитить как себя, так и свою технологию от захвата.