Ниндзя продолжают существовать как реальная группа, сохраняя скрытность и совершенствуя свои навыки. На протяжении веков они выполняли функции защитников для влиятельных лиц, осуществляя секретные миссии. Подготовка таких специалистов ведется в Академии Хандзо, учебном заведении, где все учащиеся являются девушками. Каждая ученица осваивает боевые искусства и стратегическое мышление, демонстрируя индивидуальные способности в различных дисциплинах.

Ученицы обладают разными специализациями, включая искусство скрытности, рукопашный бой и тактическое планирование. Группа, действующая сплоченно, получает от своего наставника важное задание. В процессе его выполнения они встречают ниндзя из конкурирующей академии, преследующих аналогичные цели. Между группами возникает противостояние, в ходе которого применяются различные тактические приемы. Исходом становится победа героинь, достигнутая за счет координации действий и сообразительности.