В рамках вселенной Gundam события серии связаны с исходной хронологией. Gundam Z является продолжением оригинальной Mobile Suit Gundam, где конфликт разворачивался между Земной Федерацией и Княжеством Зион. После победы Федерации напряженность не исчезла, что привело к формированию антиземного движения, известного как Союз борцов с Землей. Эта организация ставит своей целью противодействие элитному подразделению Федерации «Титаны», а в её рядах состоят как бывшие пилоты Федерации, так и выходцы из Зиона.

В 0087 году по универсальному веку происходит инцидент с участием Камиля Видана. После ареста ему удается бежать, воспользовавшись хаосом от атаки СБЗ, и захватить экспериментальный мобильный доспех Gundam. Однако вскоре он оказывается в руках у повстанцев. Эта ситуация ставит перед Камилем сложный выбор касательно определения сторон в конфликте, который затрагивает судьбы его близких. Ему предстоит пересмотреть свои представления о союзниках и противниках.