Студент Такуя Арима приезжает к отцу на летние каникулы, но не застаёт его дома. Вместо этого он обнаруживает письмо и необычное устройство. В послании отец, исследователь параллельных миров, сообщает о создании прибора для межпространственных перемещений и о своём похищении неизвестной организацией. Такуя изначально скептически относится к содержанию письма, считая его плодом воображения.

Позже юноша эмпирически убеждается в функциональности устройства и, следовательно, в правдивости слов отца. Он принимает решение начать поиски, используя прибор для перемещений. Его путь осложняется противодействием преступной группировки, которая также стремится завладеть технологией. Сюжет строится вокруг противостояния Такуи и этой организации, а также расследования обстоятельств исчезновения его отца.