Накадзима Нанао является студентом специализированного учебного заведения. Школа расположена на небольшом необитаемом острове вдали от крупных городов. Её цель — подготовка молодых людей, обладающих особыми навыками, для противодействия существам, классифицируемым как «враги человечества». Учебный процесс сосредоточен на развитии индивидуальных способностей учащихся, которые в перспективе должны стать основным оружием в этой борьбе. Повседневная жизнь Нанао протекает в среде, где доминируют сильные личности, чьи таланты делают их ключевыми фигурами в программе обучения.

Положение Нанао осложняется тем, что он не проявляет никаких особых способностей, что выделяет его среди однокурсников и делает объектом насмешек. Ситуация меняется с прибытием в класс двух новых учеников: Онодера Кёя и Хиираги Нана. Финансируемая государством система обучения предоставляет носителям способностей все условия для развития. Однако истинные мотивы одной из новеньких остаются скрытыми. Внешне неловкая и старающаяся наладить контакт, Хиираги Нана действует по заданию, и её целью является устранение учащихся, обладающих сверхъестественными навыками.