После победы над Петельгейзе Романе-Конти, Субару Нацуки рассчитывает на период затишья и возможность встретиться с Эмилией. Однако его планы нарушает нападение на повозку, в которой находились Рем и Круш. Атаку совершают двое представителей Культа Ведьмы. В результате этого инцидента обе девушки теряют воспоминания, а существование Рем полностью стирается из памяти всех окружающих, включая её близких.

Столкнувшись с новой угрозой, Субару осознает, что конфликт с культом не завершен. Основной его задачей становится защита Эмилии и других союзников, которые оказываются в опасности из-за деятельности организации. События развиваются в условиях, когда последствия нападения создают дополнительные сложности для группы, вынужденной действовать в ситуации частичной потери информации и ослабленных позиций.