После победы над Петельгейзе Романе-Конти, Нацуки Субару рассчитывает на период затишья и воссоединение с Эмилией. Однако его планы нарушает нападение на повозку, в которой находились Рем и Круш. Агрессорами оказываются двое представителей Культа Ведьмы. В результате инцидента обе девушки теряют память, а существование Рем стирается из воспоминаний всех окружающих, кроме самого Субару.

Столкнувшись с новой угрозой, Субару осознает, что конфликт с последователями Ведьмы не исчерпан. Основной его задачей становится обеспечение безопасности Эмилии и других спутников, которые могут стать следующими целями культа. События вынуждают его вновь анализировать обстановку и искать способы противостоять противникам, обладающим необычными способностями.