Накадзима Нанао является учеником специального курса в учебном заведении, расположенном на удаленном необитаемом острове. Школа предназначена для подготовки молодых людей, обладающих особыми навыками, к противостоянию с существами, классифицируемыми как враги человечества. Учебный процесс сосредоточен на развитии индивидуальных способностей учащихся, которые в перспективе должны стать основным оружием в этой борьбе. Нанао вынужден существовать в среде, где доминируют сильные личности, чьи таланты делают их ключевыми фигурами в программе обучения.

Положение Нанао осложняется тем, что он не проявляет никаких особых способностей, что делает его объектом насмешек и давления со стороны одноклассников. Ситуация меняется с прибытием в класс двух новых учеников: Онодера Кёя и Хиираги Нана. В то время как система обучения финансируется государством и предоставляет обладателям способностей условия для развития, истинные цели Хиираги Нана скрыты. Под видом неловкого новичка она действует по заданию, и ее миссией является устранение учащихся, одаренных сверхъестественными силами.