Второй сезон повествует о дальнейшем обучении Рима Накамуры и его товарищей в академии экзорцистов. Рин, являющийся сыном Сатаны, после гибели приёмного отца поступил в это учебное заведение с целью противостоять Повелителю Ада. Директором академии выступает Мефистофель, который стремится помочь главному герою раскрыть свой потенциал для будущей конфронтации. Однако Рин сосредоточен на повседневной учёбе и налаживании отношений с одноклассниками, не форсируя развитие своих демонических сил.

На ситуацию обращает внимание Церковь, направляющая для проверки происхождения Рима старшего экзорциста первого ранга Сюру. После неудачной попытки ликвидации она, услышав аргументы юноши о его намерениях, решает дать ему шанс. Сюра становится преподавателем в академии, взяв на себя наблюдение за Ринем, чтобы предотвратить пробуждение его тёмной стороны. Её решение также мотивировано личным долгом перед приёмным отцом главного героя. Тем временем Сатана выжидает подходящий момент для вселения в тело одного из своих сыновей с целью уничтожения человечества.