Ацуко, главная героиня аниме "Академия ведьмочек", получает письмо о зачислении в учебное заведение, где преподают магию. Она переезжает в академию, чтобы начать обучение. Однако на новом месте её встречает холодное отношение со стороны других студентов, которые смотрят на неё свысока из-за деревенского происхождения. Часть учащихся считает, что Ацуко не место в академии, и они предпринимают действия, чтобы заставить её уйти.

Несмотря на давление, Ацуко принимает решение остаться и продолжить обучение, рассматривая эту возможность как исполнение своей мечты. Сюжет также раскрывает подробности об истории учебного заведения и происхождении определённого магического артефакта. В повествование включены линии, касающиеся прошлого преподавательницы Урсулы и семьи одной из студенток, Дианы. Визуальный стиль аниме сохраняет преемственность с предыдущими работами студии.