Аниме "Боруто: Новое поколение Наруто" продолжает историю мира ниндзя, сосредотачиваясь на Боруто Узумаки, сыне Седьмого Хокаге Наруто. Действие происходит в эпоху технологического прогресса в Скрытом Листе. Боруто демонстрирует природный талант к техникам ниндзя и выделяется сообразительностью среди сверстников в академии. Однако его отношения с отцом напряжены из-за постоянной занятости Наруто обязанностями лидера деревни. Это отсутствие внимания приводит к внутреннему конфликту Боруто и формирует его критическое отношение к положению Хокаге.

Сюжет развивается вокруг команды, в которую, помимо Боруто, входят Сарада Учиха и Мицуки. Сарада, дочь Саске и Сакуры, стремится стать Хокаге, сочетая аналитический ум и физическую силу. Мицуки, создание Орочимару, обладает выдающимися способностями и спокойным характером, его мотивы часто остаются загадкой. Под руководством капитана Конохамару Сарутоби команда выполняет миссии, сталкиваясь с новыми угрозами в изменяющемся мире. Центральной интригой становится противостояние Боруто с системой, олицетворяемой его отцом, и раскрытие тайн, связанных с технологией кармы и инопланетной организацией Кара.