Харуаки Яти — старшеклассник, чей отец, учёный-исследователь, редко бывает дома из-за экспедиций. Однажды юноша получает посылку от отца, в которой обнаруживает необычный кубик. Изучая предмет, Харуаки выясняет, что кубик способен трансформироваться в различные объекты и обладает множеством функций, назначение которых изначально ему непонятно.

Случайная активация устройства выявляет его потенциально опасные свойства. Ситуацию проясняет Феар Кубрик, представительница организации «Кубическая фундация». Она сообщает, что кубик создан отцом Харуаки и является частью серии подобных артефактов. Присоединившись к организации для изучения тайн кубика, Харуаки и его новые союзники сталкиваются с противодействием других групп, стремящихся завладеть технологией любыми методами.