В альтернативной реальности Британская империя установила глобальное господство, присоединив к своим территориям Японию под названием «Зона 11». Оккупационный режим поддерживается военным присутствием и подавлением любых проявлений сопротивления со стороны местного населения. В ответ на это формируется подпольное движение, стремящееся вернуть стране независимость.

Лелуш Ламперуж, бывший принц Британии, живущий в Японии под прикрытием обычного студента, случайно оказывается в центре столкновения между повстанцами и армией. В критический момент его спасает девушка по имени С.С., которая наделяет его силой «Гиас» — способностью отдавать абсолютно исполнимые приказы любому человеку. Используя эту способность и скрывая лицо под маской, Лелуш принимает личность Зеро, чтобы возглавить борьбу против империи и осуществить план по свержению правящего режима, включая своего отца, императора.