После успешной защиты Новой Вестрои бойцы бакуган получили возможность отдохнуть. Бакуганы выразили признательность своим партнерам-людям за помощь в предотвращении порабощения. Однако период затишья оказывается недолгим. На планету прибывает Рен Кролер, уроженец Гандэлии, который обращается к Отчаянным бойцам с просьбой о помощи против якобы агрессивной Нифии. Его история вскоре ставится под сомнение принцессой нифийцев Фабией, которая также ищет контакта с командой.

Фабия раскрывает, что истинной угрозой является Гандэлия, планирующая после захвата Нифии напасть на Землю. Пока команда осознает новый приоритет — защиту чужой планеты, Рен Кролер начинает действовать, подчиняя своей воле других бойцов бакуган для создания личной армии. Дэн и его союзники сталкиваются с масштабной угрозой, требующей от них решительных действий и готовности к новым сражениям в рамках игры бакуган, от исхода которых теперь зависит судьба нескольких миров.